A través del protocolo oficial 004/25 emitido el 16 de enero de 2025 el Dicasterio para el Clero destituyó a Alejandro Gwerder como sacerdote tras un proceso en su contra por delitos contra la obediencia, la comunión y las obligaciones inherentes al ministerio sacerdotal. La decisión fue confirmada por el Arzobispado de Mercedes-Luján expresando un mensaje de esperanza y oración por el sacerdote sancionado, invocando al Señor y a la Virgen para que lo acompañen en este «tiempo importante» de su vida.
La medida se enmarca en las normativas del Derecho Canónico que regulan la conducta de los miembros del clero y subrayan el compromiso de la Iglesia con la disciplina y la transparencia. Con esa sanción, Gwerder queda inhabilitado para ejercer el sacerdocio, predicar y desempeñar cualquier otra tarea eclesiástica.